Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM8A1Q9UBU6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms