Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC17A6Q9P2U8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms