Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms