Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOMER3Q9NSC5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms