Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCDHB16Q9NRJ7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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