Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SLC6A20Q9NP91 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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