Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf49Q9H6J7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms