Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPEF2Q9C093 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms