Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC8Q9BY41 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms