Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB2BQ9BVA1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms