Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SHANK2-AS3Q9BTD1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms