Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTKNQ9BST9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms