Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SGIP1Q9BQI5 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms