Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGBD4Q96DM1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGBD4Q96DM1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms