Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG4Q92954 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms