Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms