Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSRNP3Q8WYN3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSRNP3Q8WYN3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms