Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM41Q8WV44 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms