Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC12Q8WUD4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC12Q8WUD4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms