Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms