Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1AQ8N9B8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1AQ8N9B8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms