Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U1

MS4A15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A15Q8N5U1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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MS4A15Q8N5U1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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MS4A15Q8N5U1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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MS4A15Q8N5U1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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MS4A15Q8N5U1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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MS4A15Q8N5U1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A15Q8N5U1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A15Q8N5U1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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