Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ52

CHPF, Chondroitin sulfate synthase 2, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPFQ8IZ52 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CHPFQ8IZ52 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CHPFQ8IZ52 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CHPFQ8IZ52 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CHPFQ8IZ52 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CHPFQ8IZ52 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CHPFQ8IZ52 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CHPFQ8IZ52 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHPFQ8IZ52 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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