Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDKL3Q8IVW4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms