Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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