Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP350Q5VT06 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms