Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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COL5A1-AS1Q5SY13 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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