Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms