Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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