Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK5Q16478 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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GRIK5Q16478 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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