Protein–RNA interactions for Protein: Q15846

CLUL1, Clusterin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUL1Q15846 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CLUL1Q15846 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CLUL1Q15846 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms