Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms