Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms