Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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KCNB1Q14721 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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KCNB1Q14721 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNB1Q14721 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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