Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SSPNQ14714 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms