Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NME3Q13232 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NME3Q13232 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NME3Q13232 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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NME3Q13232 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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