Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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FOXC1Q12948 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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FOXC1Q12948 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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FOXC1Q12948 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXC1Q12948 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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