Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH17Q12864 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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