Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
POLEQ07864 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLEQ07864 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLEQ07864 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLEQ07864 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLEQ07864 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLEQ07864 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
POLEQ07864 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
POLEQ07864 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
POLEQ07864 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms