Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms