Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DSG1Q02413 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms