Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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