Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
E2F1Q01094 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
E2F1Q01094 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms