Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms