Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HBBP68871 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
HBBP68871 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms