Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCDC1P59894 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms