Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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