Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAD23AP54725 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms