Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB3P54284 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms