Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEK3P51956 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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